La Sanidad Vegetal en el ITG Agrícola se enclava dentro del Área de Protección de Cultivos y debido a su carácter multifuncional, destaca la diversidad de consultas que recibe, desde todos los sectores del agro-navarro (organismos oficiales, cooperativas, agricultores, empresas del sector agrícola, universidades, etc.). 

Para conseguir que esta labor informativa sea dinámica, actual y satisfaga las exigencias del sector, el Área apoya su trabajo en estos tres grandes pilares: Estación de Avisos, experimentación y desarrollo y Registro de fitosanitarios

• La Estación de Avisos es el gran soporte para poder precisar los momentos óptimos de intervención contra las diferentes plagas (sobre todo) y enfermedades de cada uno de los cultivos controlados. Se mantiene efectiva a lo largo de todo el año, emitiendo Avisos que atraen el interés de los agricultores, a través de informaciones escritas (Avance Informativo, Hojas Informativas, periódicos etc), de Internet y del teléfono móvil (mensajes cortos).

• La Experimentación y Desarrollo, con ensayos de técnicas y recursos de todo tipo, donde los fitosanitarios son un medio más de control aunque todavía muy importante en la actualidad. Se evalúan nuevos fitofármacos próximos a registrarse, se asignan umbrales de tratamiento para malas hierbas, plagas y enfermedades, se comprueba la necesidad de tratar y se fijan sus momentos óptimos, se estudian y desarrollan alternativas a la lucha química, etc..

• Debido a los continuos cambios que se están produciendo en el Registro de los fitosanitarios, precisa una puesta a punto casi diaria, con el fin de que todas las aplicaciones cumplan las disposiciones legales y no entrañen ningún riesgo sanitario ni económico para el aplicador ni para el consumidor.