El Área de Hortofruticultura se ocupa de las tareasde experimentación, investigación básica y aplicada, demostración, divulgación, asesoramiento y transferencia de tecnología al sector, en lo relacionado con los cultivos hortícolas, agroindustriales y frutales, incluyendo asimismo, los principales cultivos extensivos de regadío de la región, como maíz, tanto grano como forrajero, alfalfa y arroz.

Una de las características destacable del sector de la hortofruticultura navarra es la gran diversidad de cultivos existente, lo que supone a su vez que la superficie cultivada de cada uno de ellos sea relativamente pequeña en algunos casos.